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萝莉 telegram 高频CCR5裁剪, 或能防碍ART停药后HIV的再激活, 从而终了HIV休养
发布日期:2025-01-16 10:06    点击次数:146

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近日,《天然通信》上发布了一篇名为《东说念主类造血干细胞中的高频率CCR5裁剪可保护异种移植小鼠免受 HIV 感染》的著述。

这项辩论模仿了柏林患者的休养陶冶,该患者被宇宙公以为第一例通过干细胞移植休养HIV的患者。辩论者们通过CRISPR/Cas9期间对东说念主类造血干祖细胞(HSPC)进行CCR5基因裁剪,生效终明晰90%以上的CCR5裁剪,况兼移植后的细胞梗概正常进行造血,生成衰败CCR5的T细胞,从而使小鼠对HIV感染具有免疫拒抗力。

执行还发现,当CCR5裁剪率低于90%时,保护遵守会缓缓松开,而在裁剪率越过90%时,能有用防护HIV感染和复制。

这些完结标明,欺骗CRISPR期间对HSPC进行高频CCR5裁剪,不仅可行,而且梗概有用拒抗HIV感染,为HIV的休养辩论提供了新的想路。

01造血干细胞移植

天然现存的抗HIV休养不错礼貌病毒,但不可休养HIV,因此仍在寻找新的休养尺度。几位患者通过罗致带有CCR5Δ32/Δ32基因突变的造血干细胞移植,生效终明晰HIV弥远缓解,这阐述HIV休养是可能的。不外,由于这类移植的复杂性和风险,难以畴昔应用。

基因裁剪期间,尤其是CRISPR/Cas9的逾越,带来了新的但愿。通过在患者我方的造血干细胞中裁剪CCR5基因,不错幸免异体移植的风险,并终了自体移植。但要高效裁剪CCR5基因仍然存在挑战,尤其是在保抓细胞的多能性和移植材干方面。

辩论标明,要有用防碍HIV复发,需要较高频率的CCR5基因裁剪,至少达到90%。

文中辩论通过CRISPR/Cas9生效在成东说念主的造血干细胞中终明晰越过90%的CCR5裁剪,且这些裁剪后的细胞保抓了正常的造血材干,并能有用拒抗HIV感染。这为畴昔自体CCR5基因裁剪移植休养HIV提供了伏击的辩论基础。

02研发CCR5裁剪基因

发现过程识别出最好CCR5特异性指示RNA

辩论东说念主员通过计算机瞻望和体外筛选相伙同,找到了能高效裁剪CCR5基因的最好指示RNA(gRNA)。领先,他们计算出123个可能在CCR5基因上酿成双链断裂的gRNA,并遗弃了15个可能与其他基因伙同的gRNA。

剩下的108个gRNA在执行中与Cas9卵白伙同,测试了它们在成东说念主动员的造血干细胞中的裁剪遵守。完结发现,其中11个gRNA的裁剪遵守越过30%,且不与CCR2基因同样,因此被选中进行进一步优化。

在进一步测试中,辩论团队通过电穿孔期间进行裁剪,并通过深度测序搜检可能的非靶向裁剪(即不在指标基因上的空幻裁剪)。

完结线路,除一个gRNA(TB8)外,其它三个gRNA险些莫得发生非靶向裁剪。最终,他们笃定了四个高效且安全的gRNA,并遴荐这些行动进一步执行的基础。

最好CCR5靶向gRNA显赫减少东说念主类T细胞名义的CCR5抒发

辩论东说念主员测试了四种最好的gRNA(TB7、TB8、TB48和TB50),望望它们是否梗概有用裁剪CCR5基因,并影响T细胞名义的CCR5卵白抒发。

完结线路,所有四种gRNA在T细胞中的裁剪遵守齐很高,介于52%到70%之间,况兼齐能有用镌汰CD4+和CD8+ T细胞名义CCR5的抒发(CCR5+)。比拟之下,使用假“裁剪”gRNA时,CCR5+细胞的比例判辨减少。

接着,辩论团队将TB48和TB50伙同使用,罗致“双重指示”尺度,模拟CCR5Δ32突变的遵守。这个尺度也能强效裁剪CCR5基因,并镌汰CCR5的抒发。值得一提的是,这些裁剪在培养10天后也曾有用,且莫得不雅察到未裁剪细胞的扩增或CCR5抒发变化。

临了,辩论东说念主员通过AUC分析量化了CCR5+细胞频率的变化,发现TB48、TB50以及双重指示的组合在减少CCR5+ CD4+和CD8+ T细胞的频率方面,比TB7和TB8更有用。

CCR5裁剪使东说念主类CD4+ T细胞具备抗HIV的材干

为了考证CCR5裁剪抵抗HIV的遵守,辩论东说念主员对来自三位不同供体的外周血单核细胞(PBMCs)进行了高剂量的HIV挑战,使用了不同的gRNA裁剪尺度。完结线路,与使用假GFP裁剪的CD4+ T细胞比拟,所有CCR5裁剪的CD4+ T细胞的感染率显赫镌汰。

很是是在测试的三位供体中,使用TB48、TB50和TB48+TB50双重指示进行CCR5裁剪的细胞,在6天后的HIV感染进度与假感染对照组险些换取。

通过对感染细胞频率和感染包袱的分析,辩论发现,TB48、TB50或TB48+TB50双重指示裁剪的细胞,HIV感染频率判辨低于TB7和TB8裁剪的细胞。此外,CCR5+ CD4+ T细胞频率的镌汰与HIV感染频率的减少致密干系。

这些完结标明,CCR5裁剪梗概有用赋予CD4+ T细胞抗HIV的材干,况兼TB48+TB50双重指示尺度具有很大的辩论后劲。

CCR5裁剪不影响东说念主类CD34+ HSPC的弥远移植和造血功能

为了评估高频CCR5裁剪对造血干细胞(HSPC)的影响,辩论东说念主员使用TB48和TB50这两种gRNA与Cas9卵白对三位健康成东说念主的动员造血干细胞进行了电穿孔。

裁剪后48小时,完结线路,三位供体的CCR5裁剪遵守高达91%至97%。电穿孔后的细胞存活率越过95%,况兼不同裁剪条目下,细胞的回收率相当。

在单细胞执行中,辩论发现,无论是使用假裁剪(GFP gRNA)照旧双重gRNA(TB48+TB50)的裁剪,造血干细胞的克隆数量和谱系构成莫得显赫各异。随后,辩论东说念主员将裁剪后的HSPC移植到免疫弱势小鼠中,不雅察其弥远移植遵守。

天然在移植后的一个月内,使用CCR5裁剪的HSPC的小鼠血液中东说念主类CD45+细胞的数量较低,但跟着时分的推移,这一各异缓缓隐藏。

最伏击的是,无论是未裁剪的、假裁剪的,照旧CCR5裁剪的HSPC移植小鼠,红系、髓系和淋巴系东说念主类细胞的散播和比例同样,标明电穿孔过程或高频CCR5裁剪不会影响HSPC的造血后劲。

CCR5缺失的东说念主类造血异种移植的清晰性

辩论东说念主员评估了高频CCR5裁剪对东说念主类造血干细胞(HSPC)移植的清晰性和功能性影响。他们量化了移植了越过90% CCR5裁剪HSPC的小鼠中,髓系细胞(CD33+)和T细胞(CD3+)中CCR5+细胞的变化。

完结线路,这些小鼠的髓系细胞和T细胞险些莫得CCR5抒发,判辨低于移植了未裁剪或假裁剪(GFP)HSPC的小鼠。

在6个月的追踪中,移植了CCR5裁剪HSPC的小鼠中,髓系细胞中CCR5+细胞的比例低于2%,而对照组小鼠为约30%。另外,T细胞也险些莫得CCR5抒发,标明这些细胞对HIV的易理性大大镌汰。

在另一项孤独的辩论中,使用来自另一位健康供体的HSPC进行雷同的裁剪和移植,得回了同样的完结。

这标明,使用双重gRNA尺度高效裁剪CCR5的HSPC,不错形成险些不含CCR5抒发的东说念主类造血移植物,基本终明晰CCR5Δ32/Δ32突变的遵守,提供了HIV防治的新主义。

CCR5 裁剪的频率决定了HIV感染的风险

CCR5裁剪的异种移植小鼠对HIV感染具有免疫樊篱

在移植了TB48 + TB50双重gRNA CCR5裁剪HSPC的小鼠中,CCR5抒发的CD4+ T细胞显赫减少,标明这种移植可能具备对HIV的抗性。

为了考证这少量,辩论东说念主员用高剂量的CCR5趋向性HIV(HIVJRCSF)对小鼠进行挑战,并将CCR5裁剪小鼠与假裁剪(GFP gRNA)对照组进行比较。

完结线路,所有假裁剪小鼠在挑战后齐被感染,且血浆中的HIV RNA水平在2周内大幅高潮,越过了10^3拷贝/mL。而CCR5裁剪的小鼠则有用拒抗了HIV感染,致使在进行五倍剂量的后续挑战后仍未感染。

在对照小鼠中,HIV感染导致CD4+ T细胞快速减少,而CCR5裁剪的小鼠则莫得这种细胞丧失。通过数字滴度PCR(ddPCR)检测,辩论东说念主员在CCR5裁剪小鼠中莫得发现低水平或非坐褥性HIV感染的字据,这些小鼠在挑战后5周的尸检中,淋巴结组织未检出HIV整合DNA。

为了确保保护遵守照实来自CCR5裁剪而非裁剪过程的反作用,辩论东说念主员用CCR5裁剪小鼠再次进行挑战。

尽管这些小鼠生效拒抗了之前的HIVJRCSF感染,但当用替代共受体CXCR4的HIV株(HIVNL43)进行挑战时,小鼠生效感染并推崇出热烈的HIV病毒血症。这阐述CCR5裁剪小鼠的抗HIV遵守是特定于CCR5抒发去除的。

这些完结标明,通过高频CCR5裁剪的东说念主类造血干细胞(HSPC)移植,不错有用重建CD4+ T细胞,并使其对CCR5趋向性HIV产生免疫保护。

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CCR5裁剪HSPC的不同剂量对HIV感染偏执病理的影响

在前边的辩论中,移植了越过90% CCR5裁剪东说念主类造血干细胞(HSPC)的小鼠能十足拒抗CCR5趋向性HIV的挑战。但在本体临床中,可能会际遇CCR5裁剪频率较低或者移植生遵守较低的情况。

为了评估较低频率CCR5裁剪的保护遵守,辩论东说念主员在免疫弱势小鼠中进行了执行,移植了不同剂量的CCR5裁剪HSPC,并将其与假裁剪(GFP gRNA)细胞夹杂,构成不同的移植组合。

这项辩论使用了NBSGW小鼠,这种小鼠的突变不错避将就度全身照耀,从而提妙手类造血干细胞(HSPC)的移植遵守。

辩论树立了五个组,分离罗致了100%、75%、50%、25%和0%剂量的CCR5裁剪细胞。完结线路,移植后,CCR5裁剪的频率在不同组间有所不同,分离为26%、54%、69%和96%。

与此同期,移植的CCR5裁剪细胞量与外周血中CD33+髓系细胞和T细胞上CCR5抒发的比例一致。

接下来,这些小鼠每周罗致高剂量CCR5趋向性HIV(HIVJRCSF)挑战,抓续8周,以评估不同CCR5裁剪剂量的保护遵守。

完结线路,CCR5裁剪频率最低(26%)的小鼠组对HIV的易理性与对照组换取,所有小鼠齐感染了HIV。而跟着CCR5裁剪剂量的加多,保护遵守缓缓增强。与前期辩论一致,裁剪比例最高(96%)的组在8次挑战中齐未感染,推崇出十足的保护遵守。

通过生计弧线分析,辩论东说念主员发现,CCR5裁剪频率最低的组(26%)与对照组感染风险莫得显赫各异,挑战中的感染风险为0.28。

而CCR5裁剪比例为54%的组感染风险镌汰了45%(0.16),但这一变化未达到统计学显赫性。比拟之下,CCR5裁剪比例为69%和96%的两组则推崇出了显赫的保护遵守,感染风险分离镌汰了82%(0.051)和100%(十足免疫)。

CCR5裁剪对HIV感染风险的影响偏执机制模子

辩论东说念主员随后分析了所有小鼠的HIV感染数据和CCR5裁剪散播,并劝诱了一个模子,估算CCR5裁剪频率对感染风险的影响。根据该模子,CCR5基因裁剪越过98%的小鼠需要接种越过100次才能感染HIV。

为了更准确评估感染风险,辩论东说念主员根据每只小鼠的本体CCR5裁剪频率,将它们分红五个组。完结线路,CCR5裁剪频率最低的组(0–40%)的小鼠感染率较高,而跟着裁剪频率加多,感染率缓缓下落。

除了CCR5裁剪对HIV感染的保护作用,辩论还探求了CCR5抒发细胞减少对病毒载量的影响。辩论东说念主员以为,跟着CCR5阴性HIV耐受性CD4+ T细胞比例的加多,靶细胞数量下落,最终可能防碍HIV传播,这个状况被称为“传播樊篱”。

分析完结线路,CCR5裁剪较高的小鼠病毒载量较低,未感染的动物数量加多。不外,探求到传播樊篱机制后,模子的拟合遵守并莫得显赫改善,因为在高CCR5裁剪水平下,独一少数小鼠可能会感染。

03论断

这项辩论基于柏林患者的生效陶冶,探讨了使用CRISPR/Cas9期间裁剪动员的CD34+ HSPCs中的CCR5基因,以复制CCR5Δ32/Δ32的保护遵守,激动自体干细胞移植(HSCT)行动休养HIV的一种畴昔应用尺度。

辩论发现,使用两种高效指示RNA不错终了越过90%的CCR5裁剪,同期不会影响干细胞的造血后劲。这标明,CRISPR/Cas9基因裁剪有望复制柏林患者等的生效,并为更畴昔的自体HSCT尺度提供了可能。

辩论标明,弥散高频的CCR5裁剪(大于90%)能有用防护HIV感染,并产生显赫的保护遵守。执行中,高频CCR5裁剪的HSPC移植梗概重建一个对HIV免疫的移植物,且不会显赫影响HSPC的弥远植入后劲。

尽管在高频裁剪组中,短期内移植的东说念主类细胞量有所减少,但这一各异在8周后隐藏,复旧了高频裁剪对弥远造血后劲的影响非常小。此外,辩论还发现,较低频率的CCR5裁剪(如低于90%)天然能镌汰感染风险,但不可十足防碍HIV感染。

在不同频率的CCR5裁剪下,辩论构建了一个模子,瞻望CCR5裁剪频率若何影响ART停药后HIV再激活的风险。

模子瞻望,90%的CCR5裁剪频率能推迟病毒反弹,而98%以上的裁剪频率能推迟至少两个月的病毒反弹。更高频率的CCR5裁剪不仅减少了感染风险,还镌汰了病毒的复制水平,从而为休养计谋提供了“传播樊篱”。

很是值得珍摄的是,辩论瞻望,当CCR5裁剪频率达到87.5%时,靶细胞的数量会减少到病毒无法有用复制的水平,从而无法保管抓续的感染。

这标明,高频CCR5裁剪可能有助于防碍ART停药后HIV的再激活,幸免病毒扩增,尤其是在衰败HIV特异性免疫的情况下。

该辩论为基因裁剪在HIV休养中的应用提供了伏击数据,阐述高频CCR5裁剪的HSPC移植梗概有用防碍HIV感染并蔓延病毒复发。这也为基于自体干细胞移植(HSCT)的HIV休养计谋提供了可行旅途。

跟着CRISPR/Cas9期间遵守栽种及安全性得回招供,畴昔自体HSCT有望成为休养HIV的新遴荐。此外,干系期间在休养镰状细胞病和β-地中海贫血等遗传病的应用也为畴昔HIV休养提供了有劲复旧。

谛视:

CCR5 (C-C chemokine receptor type 5) C-C趋化因子受体5:CCR5是HIV病毒参预细胞的通说念,成为抗HIV休养的关节靶点。

HSPC (Hematopoietic Stem and Progenitor Cells) 造血干细胞偏执前体细胞:HSPC是所有血液细胞的开端,能自我更新并分化成不同血细胞。它们在血液病休养中起着伏击作用。

HSCT (Hematopoietic Stem Cell Transplantation) 造血干细胞移植:HSCT是一种通过移植健康造血干细胞休养血液病的尺度。

gRNA (guide RNA) 指示RNA:gRNA是CRISPR期间中的RNA分子,匡助Cas9卵白准实在割指标DNA,终了基因裁剪。

Cas9 (CRISPR-associated protein 9) CRISPR干系卵白9:Cas9是一种酶,在CRISPR基因裁剪中雅致剪切DNA,匡助终了基因修改。

CD34+ (Cluster of Differentiation 34 positive) CD34阳性:CD34阳性是造血干细胞的记号,伏击于血液细胞的生成与血液病休养。

NBSGW (Nonobese diabetic severe combined immunodeficient (NOD/SCID) with a common gamma chain mutation) 非肥壮型严重集合免疫弱势(NOD/SCID)小鼠,带有共同伽玛链突变:NBSGW小鼠是一种免疫弱势小鼠,常用于免疫辩论和基因休养执行。

著述标题:High frequency CCR5 editing in human hematopoietic stem progenitor cells protects xenograft mice from HIV infection 作家:Claiborne, D.T., Detwiler, Z., Docken, S.S. et al. DOI:10.1038/s41467-025-55873-3

编译:松鼠哥萝莉 telegram



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